소년 노스트라다무스는 거대한 불길이 도시를 삼키고 땅이 갈라지며 검은 연기가 세상을 뒤덮는 악몽을 꾼다. 그의 할아버지는 그의 특별한 재능이 세상에 알려질까 두려워 그를 먼 곳으로 보낸다. 12년후 몽빼리 대학에서 의학을 공부하던 그는 허술한 당시의 의학에 나름대로 치료법과 학설을 주장하여 동료와 교수들에게 배척당한다. 마침 흑사병이 번지자 그는 퇴학의 위험을 무릅쓰고 자신이 개발한 치료법을 사용해 많은 사람들을 살려낸다. 그후 명망높은 스캘린저 박사는 그의 재능을 인정, 자신의 모든 것을 전수하고 수많은 금서들을 공개하는데...