사업가 존 해몬드는 코스타리카 서해안의 한 섬에 공룡들의 공원을 세운다. 그는 화석에 갇힌 모기의 피에서 공룡의 DNA를 채취해 6천 5백만 년 전의 공룡을 재현해낸다. 그러던 중 공원의 인부 하나가 공룡을 운반하다 죽는 사고가 발생한다. 이로 인해 쥬라기 공원의 안전성이 문제가 되고, 투자자들은 전문가들로부터의 안전성 확인을 요구한다.
이에 공룡학자인 그랜트(샘 닐) 박사, 동료 고식물학자인 엘리(로라 던) 박사, 수학자 말콤(제프 골드블룸) 박사, 변호사 제나로가 쥬라기 공원의 안전진단에 나선다.
그런데 시스템 엔지니어인 네드리는 공룡 수정란을 비싼 값에 빼돌리려는 계획을 세우고, 계획의 일환으로 쥬라기 공원의 컴퓨터 시스템을 일부 작동 정지시킨다. 설상가상으로 태풍까지 몰아닥치고 일순간에 공룡들은 사방에서 나타나게 되는데...