1950년대, 미국과 러시아는 생화학무기 개발 도중 우연히 `에이전트 레드`라는 치명적인 살상 바이러스를 개발하게 된다. 바이러스의 치명성으로 인하여 양국은 연구를 중단키로 하지만, 러시아측은 그것을 훔쳐낸다. 그리고 1971년 사고로 바이러스가 누출돼 한 마을이 전멸 당하는 사건이 발생하자 미국에 그것을 다시 넘기기로 한다. 잠수함 뉴올리언즈호가 에이전트 레드를 인계받아 안전하게 보관하는 역할을 맡고 그 잠수함에는 생화학무기 전문가인 린다 크리스찬 박사와 그녀의 전 약혼자이자 해군 수색전문가인 매트 핸드릭스가 타게 된다. 하지만 이들은 1971년 에이전트 레드 누출사고로 고향과 가족을 잃은 크레츠 박사와 나디아가 이끄는 테러집단과 마주치게 되고, 그들이 배기관에 삽입한 바이러스로 항 바이러스를 투여한 매트와 린다를 제외한 잠수함 내 전 대원이 사망하게 된다.